Existe una gran variedad de este tipo de herramientas, dejo una lista de las que encontré y cómo instalarlas.

*Dia, además de UML puedes diseñar otro tipo de diagramas como por ejemplo circuitos eléctricos
*BoUML, luego de realizar tu diseño puedes generar el código correspondiente en varios lenguajes como Java, PHP, etc.
*Gaphor, no le he probado mucho.
*Umbrello, una herramienta hecha para KDE pero funciona lo mas bien con GNOME, muy completa.
*ArgoUML, una herramienta hecha en Java que pinta muy bien

Quitando ArgoUML, si tienes alguna distrubución basada en Debian como por ejemplo Ubuntu, puedes instalar las herramientas facilmente buscando en tu gestor de paquetes o tecleando en la consola:

$ sudo apt-get install nombre_de_la_herramienta

ArgoUML lo puedes descargar de aquí
Una vez descargado, descomprimimos el tar.gz y buscamos el .jar que dice argouml, click derecho, abrir con java y ya está corriendo.

¿Conoces alguna otra que no haya nombrado?

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